中信湘雅生殖與遺傳專科醫院（以下簡稱“中信湘雅”）林戈課題組和(hé)深圳市中睿智研生物科技有限公司（以下簡稱“真邁生物”）聯合組成的(de)研究團隊在預印本服務網站BioRxiv在線發表了題為(wèi)Accurate CNV identification from only a few cells with low GC bias in a single-molecule sequencing platform的(de)學(xué)術論文。

論文的(de)擴展應用方向以可(kě)以實施用于PGT-A應用為(wèi)目标進行設計和(hé)實施。文章(zhāng)的(de)結果展示，GenoCare單分子(zǐ)測序儀的(de)微量細胞檢測方案在檢測靈敏度和(hé)時間上優于傳統NGS（Next generation sequencing）檢測方法。

基于Genocare檢測平台的(de)PGT-A的(de)檢測周期可(kě)由2-3天縮短(duǎn)至24小時內(nèi)，同時可(kě)以降低(dī)由傳統WGA（Whole Genome Amplification）帶來的(de)偏好（圖1）。為(wèi)了驗證該體系的(de)染色體異常檢測能力，該研究對6種帶有不同染色體微小結構變異的(de)細胞系進行了檢測（其中最小的(de)染色體結構異常為(wèi)1.29M的(de)一(yī)段染色體缺失），并将單分子(zǐ)測序系統的(de)分析結果與二代測序平台Illumina HiSeq X Ten的(de)結果進行了一(yī)緻性分析。研究結果表明，該檢測體系的(de)分析結果與基于二代測序平台的(de)分析結果完全一(yī)緻，對低(dī)至1.29M的(de)染色體結構異常可(kě)準确檢出（圖2）。

圖1 對比傳統WGA擴增方案 GC bias明顯降低(dī)

圖2  基于GenoCare 1600與HiSeq X Ten的(de)CNV測序結果對比

（染色體異常：46, XX, del(1p36.33-1p36.32) 1.29M）

在基于微量細胞為(wèi)研究樣品的(de)不同應用場景中，嵌合一(yī)直是困擾科研人員的(de)一(yī)個重要因素。如(rú)在植入前胚胎中，染色體非整倍體嵌合情況較為(wèi)常見。而不同類型和(hé)比例的(de)嵌合對臨床結局有一(yī)定影響。因此，對于少量細胞的(de)染色體非整倍體嵌合狀況進行準确檢測顯得尤為(wèi)重要。根據國際植入前遺傳學(xué)診斷學(xué)會PGDIS（Preimplantation Genetic Diagnosis International Society）的(de)建議，高(gāo)于80%的(de)異常嵌合建議按非整倍體處理(lǐ)，低(dī)于20%的(de)異常嵌合建議按整倍體處理(lǐ)，介于20~80%之間的(de)異常嵌合可(kě)作為(wèi)臨床醫生的(de)參考，根據具體情況來選擇處理(lǐ)方案。該研究團隊同時對該檢測體系的(de)嵌合異常胚胎的(de)檢出效力進行了評估，将正常細胞系gDNA與染色體異常細胞系gDNA按0%~100%的(de)不同比例進行混合模拟不同的(de)嵌合比率進行建庫測序檢測分析。結果表明，該檢測體系可(kě)對低(dī)至20%的(de)異常嵌合成功檢出（圖3）。

圖3 基于GenoCare 1600的(de)微量細胞系CNVs檢測結果

（染色體異常：46, XY, dup(2p25.3-2p16.2) 53.26M，20%嵌合）