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蘭州大學(xué)第一(yī)醫院
發布時間:
2020-04-02
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蘭州大學(xué)第一(yī)醫院與真邁生物在BMC Medical Genomics雜志合作發表了題為(wèi)“Fraternal twins with Phelan-McDermid syndrome not involving the SHANK3 gene: case report and literature review”的(de)研究論文。研究展示了一(yī)項基于真邁生物GenoCare測序平台開展的(de)染色體疾病Phelan-McDermid綜合征案例分析,通過單分子(zǐ)測序發現了與該染色體異常相關的(de)新的(de)緻病基因。


蘭州大學(xué)第一(yī)醫院發表基于GenoCare測序平台的(de)Phelan-McDermid綜合征案例研究成果


該研究中的(de)病例是一(yī)對7歲異卵雙胞胎,二人均具有智力殘疾、嚴重語言發展障礙、行為(wèi)異常等臨床表現,在5歲時診斷為(wèi)Phelan-McDermid綜合征。最初采用的(de)遺傳分析手段是串聯質譜和(hé)核型分析,但都沒有得到任何可(kě)靠的(de)結果,随後進行CNV-seq檢測發現在22号染色體的(de)22q13.31-22q13.33區間存在一(yī)段雜合的(de)缺失,男孩和(hé)女孩的(de)染色體分别存在一(yī)段6.36Mb和(hé)6.34Mb的(de)缺失區域。

Phelan-McDermid綜合征又名22q13缺失綜合征,主要的(de)臨床表現包括智力殘疾、全面發展延遲、肌張力低(dī)下、自(zì)閉症譜系障礙、顱面部畸形等,是由于染色體22q13區域缺失而導緻的(de)一(yī)種染色體缺失綜合征。SHANK3基因被認為(wèi)是與該病最密切相關的(de)緻病基因。 

為(wèi)獲得更精确的(de)染色體異常情況,本研究采用單分子(zǐ)基因測序平台GenoCare 1600對這兩名患者以及他們的(de)父母進行染色體異常的(de)檢測,采集外周血後進行測序。測序結果顯示,兩名患者具有一(yī)個完全相同的(de)缺失位點,是一(yī)段6Mb的(de)雜合缺失(圖1),而他們的(de)父母在該位點則是正常的(de),表明這是一(yī)個新發突變(de novo mutation)。在這6Mb的(de)缺失區域中,包含了45個蛋白編碼基因但卻不包括SHANK3基因。此外,在其母親的(de)同一(yī)條染色體上檢測到了一(yī)個小的(de)0.6Mb的(de)缺失(圖2)。

蘭州大學(xué)第一(yī)醫院發表基于GenoCare測序平台的(de)Phelan-McDermid綜合征案例研究成果

圖1:GenoCare 1600檢測結果(雙胞胎患兒)


蘭州大學(xué)第一(yī)醫院發表基于GenoCare測序平台的(de)Phelan-McDermid綜合征案例研究成果

圖2:GenoCare 1600檢測結果(患兒母親)


相比于核型分析、CMA等傳統檢測手段,單分子(zǐ)基因測序平台GenoCare 1600進行分析能獲得更精确的(de)檢測結果,更快速地(dì)發現遺傳病相關的(de)緻病位點,輔助診斷與治療。該研究中,兩名患兒的(de)染色體異常均源于胚胎,可(kě)能以嵌合的(de)形式存在,通過傳統的(de)方法無法很好地(dì)進行産前診斷,而已有的(de)一(yī)些研究顯示,基于單分子(zǐ)基因測序儀的(de)檢測體系對低(dī)至20%的(de)胚胎異常嵌合可(kě)成功檢出,因此更高(gāo)精度的(de)檢測技術有望在産前實現胚胎的(de)染色體疾病檢測,使得染色體疾病可(kě)以更早的(de)被發現,早發現早應對早治療。

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