2023年(nián)8月，真邁生物用戶俄羅斯科學(xué)院托木斯克國家研究醫學(xué)中心癌症研究所的(de)Anastasia Frolova博士在國際刊物Bulletin of Experimental Biology and Medicine在線發表題為(wèi)“Preparation of a Single-Cell Suspension from Tumor Biopsy Samples for Single-Cell RNA Sequencing”的(de)研究成果，該研究團隊開發了多種腫瘤活檢标本的(de)解離(lí)方法，均成功制備了高(gāo)于80%活力的(de)細胞懸浮液，通過GenoLab M測序儀進行scRNA-seq後，最終确定了樣品制備的(de)最佳方式為(wèi)：機械解離(lí)後，添加DNAase I的(de)膠原酶/透明質酸酶混合物一(yī)起孵育60分鍾。該研究優化了腫瘤活檢組織制備單細胞懸浮液以進行單細胞RNA測序的(de)方法。

腫瘤具有顯著的(de)細胞異質性，涉及到多種細胞類型，了解其細胞間相互作用對疾病治療至關重要。單細胞轉錄組測序(scRNA-seq)是在單個細胞水平進行高(gāo)通量轉錄組測序的(de)一(yī)項新技術，能夠有效解決細胞異質性以及組織轉錄組測序（bulk RNA-seq）被掩蓋的(de)細胞群內(nèi)轉錄組異質性難題。近年(nián)來，scRNA-seq提供了研究腫瘤細胞生物學(xué)特性和(hé)基因表達的(de)新視(shì)角，但隻有制備出高(gāo)質量的(de)單細胞懸浮液樣本，才能開展scRNA-seq研究。

該研究優化腫瘤活檢樣本制備單細胞懸浮液的(de)方法。他們通過機械離(lí)解和(hé)酶解離(lí)的(de)組合，特别是機械離(lí)解結合膠原酶/透明質酸酶混合物的(de)使用，最終獲得了至少80%存活率的(de)單細胞懸浮液。在獲得的(de)懸浮液樣本中，進行了scRNA-seq分析，成功鑒定了不同細胞類型，包括腫瘤細胞、單核細胞、T細胞、B細胞、樹突狀細胞和(hé)自(zì)然殺傷細胞。圖1是詳細的(de)scRNA-seq測序流程，從獲得腫瘤活檢組織開始到scRNA-seq測序獲得不同的(de)細胞亞群的(de)全過程。

該研究為(wèi)scRNA-seq提供了可(kě)靠的(de)樣本制備方法，能夠獲得高(gāo)質量、高(gāo)存活率的(de)單細胞懸浮液。這種方法的(de)成功為(wèi)未來腫瘤生物學(xué)研究提供了重要工具，有望幫助科學(xué)家更全面地(dì)理(lǐ)解腫瘤細胞之間的(de)交互作用和(hé)基因表達差異，為(wèi)個性化醫療和(hé)腫瘤治療策略的(de)設定提供支持。

Frolova A A, Gerashchenko T S, Patysheva M R, et al. Preparation of a Single-Cell Suspension from Tumor Biopsy Samples for Single-Cell RNA Sequencing[J]. Bulletin of Experimental Biology and Medicine, 2023, 175(4): 519-523.